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染色质开放性是指真核生物染色质和组蛋白、转录因子等是否结合的开放程度，这一特性与染色质转录活跃程度相关，从而能够揭示基因调控的机制。ATAC-seq测序与分析，即利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序，可以检测染色质开放区域，其原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质区域的特性，对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序和富集分析。
ChIP-Seq测序与分析 是指通过染色质免疫共沉淀技术特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化和文库构建；然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序，通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的 DNA 区段信息，是目前在全基因组水平研究蛋白结合靶DNA序列的重要手段，为转录因子、组蛋白修饰、核小体定位等表观遗传学的研究提供有效方法。
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